服務(wù)介紹 Service Introduction
艾基生物擁有多臺(tái)ABI 3730XL測(cè)序儀, 有近十年的 Sanger 測(cè)序經(jīng)驗(yàn),針對(duì)樣品的復(fù)雜程度摸索出一系列的解決方案,并且在 Sanger 測(cè)序平臺(tái)的基礎(chǔ)上將應(yīng)用擴(kuò)展至分子生物學(xué)上游的多個(gè)領(lǐng)域,包括:SNP 檢測(cè),片段分析, SSR/STR 分型, 基因檢測(cè), 菌種鑒定, 線粒體測(cè)序, 基因組測(cè)序,跑板等服務(wù)。
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平臺(tái)優(yōu)勢(shì) Service Advantages
質(zhì)量穩(wěn)定:精確讀長(zhǎng)達(dá) 800 bp 以上,有效讀長(zhǎng)度超過(guò) 900 bp。
準(zhǔn)確度高:QV20+ 和 CRL 值 >1000。
時(shí)效性強(qiáng):日均處理量 >2000 個(gè)反應(yīng),結(jié)果及時(shí)、準(zhǔn)確,最快 24 小時(shí)出結(jié)果。
困難模板:成熟的方案應(yīng)對(duì) High GC,AT rich,發(fā)夾結(jié)構(gòu),重復(fù)序列。
一站式服務(wù):基因組提取、引物設(shè)計(jì)、PCR 擴(kuò)增、Primer Walking、測(cè)序及結(jié)果分析。
技術(shù)流程 Technical Procedures
樣品要求 Sample Requirenments
【菌液和平板】
需過(guò)夜培養(yǎng)的菌液,至少提供 200 ul;無(wú)需培養(yǎng)可直接提取的樣品,請(qǐng)?zhí)峁?nbsp;2-4 ml 過(guò)夜培養(yǎng)的菌液;
樣品請(qǐng)注明抗性,常備抗生素:氨芐青霉素 (Amp)、卡那霉素 (Kan)、氯霉素 (Chl);
若菌液所含質(zhì)粒為超低拷貝,請(qǐng)直接提供質(zhì)粒;
除大腸桿菌以外的菌液,請(qǐng)直接提供質(zhì)粒。
【質(zhì)粒】
濃度 >50 ng/ul,總體積不少于 10 ul;
請(qǐng)確保質(zhì)粒溶解于滅菌的雙蒸水中,TE 溶解的質(zhì)粒會(huì)造成反應(yīng)失敗。
【PCR 產(chǎn)物】
已純化 PCR 產(chǎn)物:請(qǐng)確保 DNA 溶解于滅菌的雙蒸水中,濃度 >30 ng/ul,總體積不少于 20 ul。
未純化 PCR 產(chǎn)物:請(qǐng)注明片段長(zhǎng)度,條帶是否單一,原液總體積不少于 20 ul;
片段 < 100 bp 建議克隆后測(cè)序,片段 > 4 kb 建議分段擴(kuò)增后測(cè)序。
【測(cè)序引物】
濃度 ≥ 5 pmol/ul,總體積不少于 10 ul,并確保溶解于滅菌的雙蒸水中;
測(cè)序引物長(zhǎng)度盡量控制在 20-30 bp,引物過(guò)短或過(guò)長(zhǎng)均會(huì)影響測(cè)序質(zhì)量;
含兼并堿基熒光標(biāo)記或修飾的引物不適用于測(cè)序。
注意事項(xiàng) Notes
樣品登記表需按要求填寫(xiě)詳細(xì),避免問(wèn)題訂單帶來(lái)的實(shí)驗(yàn)延誤;
確保樣品與登記表名稱一致,可包含“字母”“數(shù)字”“—”;請(qǐng)避免出現(xiàn) 漢字、拉丁字母及其他特殊字符;
填寫(xiě)“測(cè)通”的樣品會(huì)默認(rèn)拼接,“雙向”測(cè)序的樣品如需拼接請(qǐng)注明;
如樣品為菌液或平板,請(qǐng)注明抗生素類型;
若測(cè)序引物不是通用引物,請(qǐng)自備或委托合成,選擇引物類型(通用 / 新送 / 已送 / 需合成)并注明濃度;
若送測(cè)質(zhì)粒不是常用載體,通用引物請(qǐng)寫(xiě)明引物全稱;
未純化 PCR 產(chǎn)物若已檢測(cè)為單一條帶,請(qǐng)?jiān)谟唵沃凶⒚?,可大大提高測(cè)序成功率;
存在特殊結(jié)構(gòu)的,如:High GC、AT rich、重復(fù)序列、發(fā)夾結(jié)構(gòu)請(qǐng)?jiān)谟唵紊蟼渥ⅲ?/span>
大量樣品送測(cè)時(shí),請(qǐng)使用電子訂單,方便核對(duì)且不易出錯(cuò)。