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微衛(wèi)星不穩(wěn)定(MSI)檢測試劑盒

貨號:P600-S

規(guī)格:16人份/盒

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產品介紹


微衛(wèi)星不穩(wěn)定(MSI)檢測試劑盒產品說明書 

(PCR-毛細管電泳法)


前言

  微衛(wèi)星(Microsatellite)是遍布于人類基因組中的短串聯重復序列。與正常組織相比,腫瘤組織的微衛(wèi)星由于重復單位的插入或缺失而導致微衛(wèi)星長度的改變,就叫做微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(Microsatellite Instability,MSI)。研究表明,MSI是由錯配修復(MMR)基因發(fā)生缺陷引起的,與腫瘤的發(fā)生密切相關。臨床上已將MSI作為結直腸癌預后和制定輔助治療方案的重要分子標志物,并應用于協助Lynch綜合征篩查。


產品介紹

  本試劑盒采用多重熒光PCR的方法對檢測位點進行擴增,通過毛細管電泳對擴增產物進行檢測,并利用分析軟件進行結果分析。其主要優(yōu)點是檢測準確全面、操作簡單快捷、結果直觀易讀等。


檢測位點

  Bat26、NR27、Bat25、NR24、Mono27


產品編號

  P600-S(16人份/盒)


儲存條件及有效期

  1.收到干冰或冰袋冷凍運輸的試劑盒后,如暫時不用,請置于-20±5℃長期保存。  

  2.有效期:-20℃保存12個月,如開啟使用,盡量避免反復凍融,試劑盒反復凍融 5 次內有效,開瓶兩個月內有效。 


擴增前試劑盒

試劑規(guī)格成分
Reaction Mix(2X)160μL×1支含PCR緩沖液
Primers Mix 65μL×1支含檢測位點的引物
熱啟動酶 13μL×1支5 U/μL
sdH2O 500μL×1支超純水


擴增后試劑盒

LIZ-50016μL×1支熒光分子量內標


實驗所需主要儀器設備

      PCR 擴增儀、ABI 毛細管電泳儀(3500、3730 等)、96 孔板式離心機、潔凈工作臺、微量移液器、 冰箱等。 


試劑盒使用方法(試劑使用前請輕微振蕩,并短暫離心)

1、基因組 DNA 準備

  請使用全基因組DNA提取試劑盒對待檢樣品進行全基因組DNA進行提取。例如:廣州艾基生物技術有限公司: iPure 細胞/血液/動物組織gDNA提取試劑盒(K316-L)等試劑盒。


2PCR 擴增

      2.1 PCR 反應 PCR 反應體系(PCR 反應液現配現用,若配制多余可-20℃保存一周,勿反復凍融。)

基因組 DNA 30ng-100ng 基因組 DNA
Reaction Mix (2X)10.0μL
Primers Mix3.0μL
熱啟動C-Taq酶 0.8μL
sdH2O補水至20.0μL


      2.2 PCR 程序

步驟

溫度

時間

循環(huán)數

預變

95

5mi


熱循環(huán)

95

30s

30

56

90s

70

30s

終延伸

70

30min


保溫

15


  備注:因各地PCR儀性能不同,循環(huán)參數中的退火溫度可適當調整,調整范圍±2℃內。亦可根據模板DNA量和檢測信號強度來調整熱循環(huán)次數。


3、毛細管電泳檢測

  將PCR擴增產物3000rpm離心1分鐘,取1μL PCR擴增產物與1μL LIZ-500和9 μL去離子甲酰胺(去離子甲酰胺需要自備)混合,將96孔板離心后進行毛細管電泳檢測。


4、數據分析

  1. 導入panel和bin之后,使用GeneMapper對原始數據進行分析,根據微衛(wèi)星不穩(wěn)定評判標準對結果進行判斷。(Panel,bin文件請聯系公司索取。)

  2.判斷標準:

   (1)高度不穩(wěn)定(MSI-H):5個分子標記中含有2個或以上出現變異。

   (2)低度不穩(wěn)定(MSI-L):5個分子標記中只有1個出現變異。

   (3)微衛(wèi)星穩(wěn)定(MSS):  5個分子標記中未出現變異。

  3.峰圖實例:

圖片1

圖1:高度不穩(wěn)定(MSI-H)


圖片2 

圖2:微衛(wèi)星穩(wěn)定(MSS)


樣本要求

   樣本類型:人 EDTA 抗凝全血。 

   樣本保存:血液樣本一經采集應盡快送檢;或-20℃±5℃保存,24 個月內檢測。基因組 DNA 一經提取應盡快檢測;或 2~8℃保存,4 周內檢測;或-20℃±5℃保存,24 個月內檢測, 凍融不超過 5 次。 

樣本DNA質量要求:DNA 應保證 OD260/OD280在 1.6~2.0 之間,濃度≥10 ng/μL。


注意事項

   1.請在使用前仔細閱讀產品說明書。 

   2. 實驗室應具備合理的生物安全防備設施和防護程序,實驗室管理應嚴格按照 PCR 實驗 室的管理規(guī)范,實驗操作人員應具備基因擴增等相關實驗操作資格。PCR 相關操作應嚴格 按照國家有關規(guī)定進行嚴格分區(qū)。實驗操作的每個階段使用專用的儀器和設備,各區(qū)各階段 用品不能交叉使用,防止核酸的交叉污染。 

   3. 實驗中使用的離心管、吸頭,應無菌及無核酸酶。 

   4. 實驗過程中需穿戴防護衣物、一次性手套、口罩。 

   5. 檢測過程中剩余的樣品、PCR 擴增產物及污染的試劑和耗材等,需按相關法規(guī)條例來消 毒和處理。 

   6. 在有效期內使用試劑盒,不同批號的試劑切勿混用。 

   7. 酶混合液相關操作應在冰上進行。其他試劑使用前應完全解凍并混合均勻,盡量避免反 復凍融。 

   8.加樣時,所有液體都要緩慢加至管底,不要殘留在管壁上,不能用手直接觸摸 PCR 管管蓋。

   9.若樣本存在質量問題時,如嚴重降解或含有 PCR 抑制劑等,檢測結果可能出現雜峰或 目的擴增產物丟失,影響結果判斷。


參考文獻

   [1] Br J Cancer. 1998;77:2343-48.

   [2] Cancer Res. 1998 Nov 15;58(22):5248-57.

   [3] Yonsei Med J. 2009;50(3):309-21.

   [4] J Clin Oncol. 2010 Jul 10;28(20):3219-26.

   [5] World J Gastrointest Oncol. 2013 Feb 15;5(2):12-19.

   [6] J Clin Oncol. 2015 Jan 10;33(2):209-17.

   [7] N Engl J Med 2015 June 25;372:2509-20.

   [8] Chin J Dig Surg. 2015 Oct;14(10):783-99.

   [9] China Cancer. 2015;24(1):1-10.

   [10]《NCCN Guidelines colon Cancer Version 3.2017》.

   [11]《中國結直腸癌診療規(guī)范》2015版.

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