HLA基因分型測序
人類白細(xì)胞抗原(Human Leukocyte Antigen,HLA),又被稱為人類的MHC(Major Histocompatibility Complex),是控制細(xì)胞間相互識別、調(diào)節(jié)免疫應(yīng)答的一組緊密連鎖基因群。HLA位于人類6號染色體短臂6p21.3上長度約4.0 Mb的區(qū)域內(nèi),具有高度的遺傳多態(tài)性。由于HLA部分基因編碼細(xì)胞表面抗原受體,成為每個人的細(xì)胞不可混淆的“特征”,是免疫系統(tǒng)區(qū)分自身和異體物質(zhì)的基礎(chǔ),而廣泛應(yīng)用于免疫相關(guān)疾病的研究、器官和骨髓移植、疫苗和藥物靶向人群篩選、腫瘤免疫研究等。艾基生物基于自主研發(fā)液相探針雜交捕獲技術(shù)平臺,提供了HLA分型的整體解決方案,全面檢測HLA-A、B、C、DRB1、DQB1、DPB1 6個基因,提供更全面更有針對性的精準(zhǔn)分型分析結(jié)果,助力科學(xué)研究。
產(chǎn)品信息
產(chǎn)品名稱 | HLA分型檢測 |
目標(biāo)區(qū)域大小 | 15.65 kb |
檢測范圍 | HLA-A、B、C、DRB1、DQB1、DPB1 |
技術(shù)平臺 | TargetSeq? |
產(chǎn)品優(yōu)勢
◇ 靈敏度高:采用特異性強(qiáng)的檢測方法,靈敏度高,所需樣本量少 |
◇ 分辨率高:實(shí)現(xiàn)6位的高精度分型 |
◇ 檢測全面:全面覆蓋HLA Ⅰ類分子(A,B,C)的全長序列和Ⅱ類分子(DRB1,DQB1,DPB1)的全外顯子序列, 檢測范圍更全面 |
◇ 準(zhǔn)確度高:基于NGS高通量測序,避免模棱兩可結(jié)果,檢測結(jié)果更準(zhǔn)確 |
◇ 選擇靈活:靈活定制HLA多位點(diǎn)基因檢測Panel |
技術(shù)路線
技術(shù)參數(shù)
樣本要求 | DNA≥500 ng(濃度≥5 ng/μL),新鮮組織≥20 mg,全血(提取基因組DNA)≥1 mL,干血片≥3片(1 cm2面積),唾液≥1 mL,口腔拭子≥1根,新鮮培養(yǎng)細(xì)胞≥5×106個,FFPE(石蠟切片)≥10片(1 cm2面積,5-10 μm) |
捕獲平臺 | AI-HLA-Cap |
測序策略 | Illumina PE150 |
服務(wù)周期 | 15個自然日 |
文獻(xiàn)案例
案例一 肺癌進(jìn)化過程中HLA等位基因的雜合性缺失和免疫逃逸現(xiàn)象
發(fā)表雜志:Cell IF:31.398 發(fā)表年份:2017
腫瘤新抗原的識別是產(chǎn)生免疫應(yīng)答的關(guān)鍵,而HLA的表達(dá)及結(jié)構(gòu)的完整性是新抗原遞呈的基礎(chǔ)。本文作者開發(fā)了一種研究HLA LOH(loss of heterozygosity in human leukocyte antigen,HLA雜合性缺失)的分析方法,從肺癌進(jìn)化角度研究了HLA拷貝雜合缺失對免疫逃逸的影響。利用該方法在肺癌研究中發(fā)現(xiàn),40%的NSCLCs樣品中存在HLA LOH現(xiàn)象,并且與高的亞克隆新抗原負(fù)荷、APOBEC介導(dǎo)的突變、細(xì)胞溶解活性的上調(diào)和PD-L1陽性相關(guān)。結(jié)果進(jìn)一步證實(shí),HLA LOH是導(dǎo)致腫瘤免疫逃逸的主因之一。
圖1 非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)中HLA LOH的表現(xiàn)
參考文獻(xiàn)
Mcgranahan N, Rosenthal R, Hiley C T, et al. Allele-Specific HLA Loss and Immune Escape in Lung Cancer Evolution[J]. Cell, 2017, 171(6):1259-1271.e11.