據(jù)統(tǒng)計(jì)約30%細(xì)胞系被交叉污染或錯(cuò)誤辨識(shí),因使用了交叉污染或錯(cuò)誤辨識(shí)的細(xì)胞而導(dǎo)致研究結(jié)論錯(cuò)誤、結(jié)果不可重
復(fù)、臨床細(xì)胞治療災(zāi)難性后果……這浪費(fèi)大量時(shí)間、精力和金錢。
因此近年NIH、ATCC、Nature和Science等對(duì)此多次發(fā)出呼吁,要求研究者對(duì)細(xì)胞進(jìn)行鑒定,如2011年美國(guó)國(guó)家標(biāo)
準(zhǔn)學(xué)會(huì)專門頒布了一份細(xì)胞STR鑒定國(guó)家標(biāo)準(zhǔn);2014 年12 月、2015 年2 月Science 雜志分別發(fā)表文章專題闡述細(xì)胞交叉
污染和錯(cuò)誤辨識(shí)嚴(yán)重性;2015 年4 月Nature通知:Nature 旗下雜志將從5 月開始要求作者鑒定論文中所用細(xì)胞系;2015
年6月有報(bào)道稱一科學(xué)家由于用錯(cuò)細(xì)胞系,撤銷Nature論文。STR(Short Tandem Repeat,短串聯(lián)重復(fù)序列)基因分型
已被ICLAC、ATCC等權(quán)威機(jī)構(gòu)作為金標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)用于細(xì)胞鑒定,目前越來越多的雜志要求在投稿時(shí)提供細(xì)胞STR分型數(shù)據(jù)。
STR基因位點(diǎn)由長(zhǎng)度為3~7個(gè)堿基對(duì)的短串連重復(fù)序列組成,這些重復(fù)序列廣泛存在于人類基因組中,可作為高度多
態(tài)性標(biāo)記,被稱為細(xì)胞的DNA指紋(如目前我們親子鑒定即采用該技術(shù)),其可通過PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))來檢測(cè)。
1、發(fā)表文章或申請(qǐng)課題經(jīng)費(fèi)前;
2、使用細(xì)胞進(jìn)行臨床治療(試驗(yàn))前;
3、準(zhǔn)備凍存保種或已凍存多年的細(xì)胞;
4、一個(gè)涉及到細(xì)胞試驗(yàn)項(xiàng)目開始/結(jié)束時(shí);
5、新得到的細(xì)胞或?qū)嶒?yàn)室培養(yǎng)5代以上的細(xì)胞;
6、細(xì)胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結(jié)果與預(yù)期差別較大;
· Nature;
· BioTechniques;
· Cancer Research;
· Cancer Discovery;
· Clinical Cancer Research;
· Molecular Cancer Research;
· Cancer Prevention Research;
· International Journal of Cancer;
· Molecular Cancer Therapeutics;
· Cell Biochemistry and Biophysics;
· Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention;
· In Vitro Cellular & Developmental Biology – Animal;
· ......
專業(yè)化團(tuán)隊(duì):積累了近5年的親子鑒定的資質(zhì)和資歷,擁有細(xì)胞生物學(xué)專業(yè)服務(wù)隊(duì)伍,專業(yè)解讀細(xì)胞STR數(shù)據(jù);
專業(yè)的結(jié)題報(bào)告:出具中/英文結(jié)題報(bào)告書(含STR分型圖譜及搜庫(kù)鑒定結(jié)果);
高準(zhǔn)確度:符合最新ANSI/ATCC標(biāo)準(zhǔn),測(cè)試結(jié)果99.99%與文獻(xiàn)吻合;
標(biāo)準(zhǔn)檢測(cè)與分析:ABI3130和3730基因分析儀和GeneMapper數(shù)據(jù)處理軟件;
多基因檢測(cè)、高靈敏度:可同時(shí)檢測(cè)21個(gè)STR位點(diǎn),僅需2ng DNA即可判斷細(xì)胞類型及可能的細(xì)胞交叉污染;
高性價(jià)比:高競(jìng)爭(zhēng)力的服務(wù)價(jià)格和完善的售后技術(shù)支持服務(wù)。
快速交付:1~48個(gè)樣品僅需3~5個(gè)工作日、49~96個(gè)樣本僅需4~7個(gè)工作日;
· 人源細(xì)胞STR分型檢測(cè);
· 小鼠源細(xì)胞STR鑒定檢測(cè);
· 人/鼠細(xì)胞交叉污染檢測(cè);
1、請(qǐng)問做細(xì)胞STR鑒定有何用?
答:細(xì)胞STR鑒定主要應(yīng)用于將人源細(xì)胞用于研究、生產(chǎn)的客戶,包括但不限于以下領(lǐng)域:醫(yī)學(xué)、遺傳學(xué)、藥物開發(fā)、疫
苗研制、生物技術(shù)和制藥行業(yè)、再生醫(yī)學(xué)、干細(xì)胞、腫瘤、免疫細(xì)胞治療、病毒檢測(cè)和治療及基礎(chǔ)細(xì)胞生物學(xué)等,通過細(xì)
胞STR鑒定,您可以:
<1>. 判斷您培養(yǎng)的該細(xì)胞是否被其他細(xì)胞交叉污染及其可能被污染的細(xì)胞名稱;
<2>. 明確知道自己正在使用的細(xì)胞是否“正確”——2015年有文獻(xiàn)報(bào)道稱:國(guó)內(nèi)建立的人源細(xì)胞系竟有高達(dá)85.51%是錯(cuò)
的!
2、若我需要鑒定的細(xì)胞沒有文獻(xiàn)報(bào)道有STR數(shù)據(jù),請(qǐng)問還能做STR鑒定嗎?
答:盡管我司建立的STR數(shù)據(jù)庫(kù)有目前最全的人源細(xì)胞系STR數(shù)據(jù),但有些文獻(xiàn)未報(bào)道STR數(shù)據(jù)的細(xì)胞系(國(guó)內(nèi)自行建立的
細(xì)胞系)在我們數(shù)據(jù)庫(kù)中可能也沒有其STR數(shù)據(jù)。不過,我們?nèi)越ㄗh您進(jìn)行細(xì)胞STR鑒定,因?yàn)橥ㄟ^該項(xiàng)檢測(cè),您可以:
<1>. 判斷您培養(yǎng)的該細(xì)胞是否被其他細(xì)胞交叉污染及其可能被污染的細(xì)胞名稱;
<2>. 您將是第一個(gè)得到該細(xì)胞系STR數(shù)據(jù)(DNA指紋)的人;
<3>. 該細(xì)胞系的STR數(shù)據(jù)將保存在我們數(shù)據(jù)庫(kù)中,方便您以后調(diào)用、比對(duì)。
3、我的研究結(jié)果發(fā)不了《Nature》,請(qǐng)問還有必要做細(xì)胞STR鑒定嗎?
答:只要您使用細(xì)胞從事相關(guān)研究工作,我們強(qiáng)烈建議對(duì)您的細(xì)胞進(jìn)行鑒定,原因如下:
<1>. 2015年有文獻(xiàn)報(bào)道稱:國(guó)內(nèi)建立的人源細(xì)胞系竟有高達(dá)85.51%是錯(cuò)的?。?!
<2>. 目前不止《Nature》需要細(xì)胞鑒定結(jié)果,很多雜志也陸續(xù)要求投稿者提供細(xì)胞鑒定數(shù)據(jù);
<3>. 退一萬步說,即使我們使用細(xì)胞的目的不是用來發(fā)表文章,如因?yàn)槲覀兪褂昧恕板e(cuò)誤”的細(xì)胞或者被其他細(xì)胞污染的
細(xì)胞,而導(dǎo)致得出不可靠的實(shí)驗(yàn)結(jié)論,那多年的辛苦豈不白費(fèi)、可惜?如2014年炒得沸沸揚(yáng)揚(yáng)的日本美女科學(xué)家小保方晴
子的STAP細(xì)胞鬧劇,后來證實(shí)是污染了胚胎干細(xì)胞。
4、請(qǐng)問該如何送樣測(cè)試?
答:為保證樣品質(zhì)量和STR鑒定效果,我們不建議客戶直接送檢自己提取好的基因組DNA。推薦客戶直接寄送細(xì)胞沉淀,
方法:用PBS將細(xì)胞洗2遍后,收集細(xì)胞于一干凈無菌離心管中,離心、去上清,即得細(xì)胞沉淀(細(xì)胞數(shù)≥106個(gè),細(xì)胞沉
淀應(yīng)至少肉眼明顯可見),用封口膜封好離心管管口以防止樣品泄漏及其他細(xì)胞污染。樣品隨冰袋寄送到我司即可。
5、請(qǐng)問貴司可以進(jìn)行人干細(xì)胞系鑒定嗎?
答:可以。目前我司的細(xì)胞系STR數(shù)據(jù)庫(kù)包含2000來株人胚胎干細(xì)胞、hiPSCs、間充質(zhì)干細(xì)胞系STR數(shù)據(jù)。
6、請(qǐng)問貴司的項(xiàng)目周期為多長(zhǎng)?
答:1~48個(gè)樣品,在確認(rèn)收到樣品及相應(yīng)款項(xiàng)后3~5個(gè)工作日內(nèi)完成鑒定;49~96個(gè)樣品,在收到樣品及相應(yīng)款項(xiàng)后4~7
個(gè)工作日內(nèi)完成鑒定工作。
1. Reid, Y.A., Characterization and authentication of cancer cell lines: an overview.Methods Mol Biol, 2011. 731: p. 35-43.
2. Capes-Davis, A., et al., Check your cultures! A list of cross-contaminated or misidentified cell lines.Int J Cancer, 2010. 127(1): p. 1-8.
3. Chatterjee, R., Cell biology. Cases of mistaken identity.Science, 2007. 315(5814): p. 928-31.
4. Lorsch, J.R., F.S. Collins, and J. Lippincott-Schwartz, Cell Biology. Fixing problems with cell lines.Science, 2014. 346(6216): p. 1452-3.
5. Neimark, J., Line of attack.Science, 2015. 347(6225): p. 938-40.
6. Zhao, M., et al., Assembly and initial characterization of a panel of 85 genomically validated cell lines from diverse head and neck tumor sites.Clin Cancer Res, 2011. 17(23): p. 7248-64.
7. Masters, J.R., Cell-line authentication: End the scandal of false cell lines.Nature, 2012. 492(7428): p. 186.
8. McLaren, R.S., Y. Reid, and D.R. Storts, Human cell line authentication: the critical first step in any project using human cell lines.Methods Mol Biol, 2013. 963: p. 341-53.
9. Announcement: Time to tackle cells’ mistaken identity.Nature, 2015. 520(7547): p. 264-264.
10. American Type Culture Collection Standards Development Organization Workgroup, A.S.N., Cell line misidentification: the beginning of the end.Nat Rev Cancer, 2010. 10(6): p. 441-8.
11. Editorial, It is time for all involved to tackle the chronic scandal of cell-line contamination. Funders first.Nature, 2009. 457: p. 2.
12. ANSI/ATCC, Authentication of Human Cell Lines: Standardization of STR Profiling. 2011, ASN-0002-2011.
13. Masters, J.R., et al., Short tandem repeat profiling provides an international reference standard for human cell lines.Proc Natl Acad Sci U S A, 2001. 98(14): p. 8012-7.
14. Edwards, A., et al., DNA typing and genetic mapping with trimeric and tetrameric tandem repeats.Am J Hum Genet,1991. 49(4): p. 746-56.
15. Sorensen, T., A Method of Establishing Groups of Equal Amplitude in Plant Sociology Based on Similarity of Species Content and Its Application to Analyses of the Vegetation on Danish commons.Biol Skr, 1948. 5: p. 1-34.
16. Ye, F., et al., Genetic profiling reveals an alarming rate of cross-contamination among human cell lines used in China.FASEB J, 2015. 29(10): p. 4268-72.