本試劑盒利用Picogreen DNA染料能夠特異性結(jié)合雙鏈DNA,而不與蛋白質(zhì)、RNA、鹽離子結(jié)合的原理,通過激發(fā)光照射,Qubit檢測儀收集發(fā)射光,特異的分析樣品中雙鏈DNA的實(shí)際含量,能夠排除樣品中蛋白質(zhì)、RNA、鹽離子等物質(zhì)的干擾,從而對雙鏈DNA進(jìn)行精準(zhǔn)的定量。
Nanodrop系列微量分光光度計采用目前最常見的紫外吸光法對待測樣品的濃度及純度進(jìn)行檢測,由于它會檢測吸光度在260nm處所有物質(zhì)的吸光值(如DNA、RNA、降解核酸和游離核苷酸等其他雜質(zhì)),因此讀數(shù)并不是十分準(zhǔn)確。而熒光計通過熒光染料與特定目標(biāo)分子結(jié)合后,檢測其熒光強(qiáng)度來測目標(biāo)分子的濃度,因此其定量結(jié)果一般低于A260nm處的讀數(shù),但是更為準(zhǔn)確。
另外,準(zhǔn)確的DNA定量對于許多后續(xù)應(yīng)用而言都至關(guān)重要。 Nanodrop系列全波長微量分光光度計無法精確測定5ng/ul以下的DNA濃度,然而,許多DNA樣品又恰在這個范圍之內(nèi)。在檢測雙鏈DNA時,熒光計的檢測極限可達(dá)0.5pg/ul。此時,更為靈敏的熒光計似乎是個更好的選擇。 熒光計和相應(yīng)的定量試劑盒,能快速靈敏、精確測定DNA的濃度。
本試劑將被用于成本昂貴的下游實(shí)驗(yàn):qPCR 、PCR克隆、轉(zhuǎn)染和新一代測序等精密測定的實(shí)驗(yàn),精準(zhǔn)定量范圍10 pg /μL至100ng/μL。
圖1.與Thermofisher (Cat.no.Q32854)測試標(biāo)準(zhǔn)品與樣品結(jié)果比較
圖2. 測試標(biāo)準(zhǔn)品及樣品的穩(wěn)定性
分別用Q32854與Ipure HS dsDNA assay kit對準(zhǔn)品和三個樣品進(jìn)行測試,結(jié)果如圖1. 高度的一致性,說明可以完全取代Q32854的檢測;用Ipure dsDNA assay kit 對樣品和標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行測量,放置2個小時后重新測量,結(jié)果如圖2.說明書Ipure HS ds DNA assay kit 高度的穩(wěn)定性。
將Ipure HS dsDNA assay kit儲存室溫、4℃、37℃烘烤,評估了1天、3天、7天、1個月。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示測量樣品時無明顯差異,說明試劑穩(wěn)定性好。