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環(huán)狀RNA為什么火？它到底是何方神圣？

        近幾年關于 circRNA 的研究如火如荼，當前，我們也已經(jīng)對 circRNA 有個大概的認識，比如什么是 circRNA、它是

怎么形成的以及它在不同物種不同組織中普遍存在。據(jù) circBank 的不完全統(tǒng)計，人類細胞和組織中大約發(fā)現(xiàn)了 14 萬條

circRNA轉錄本。這么多的 circRNA 到底具有什么樣的功能呢，其實最終的問題是它對我們?nèi)祟愑惺裁从媚?？有錢且瘋狂

的中國研究者不惜將人類所有疾病都測序一遍，最后發(fā)現(xiàn) circRNA 分子確實在疾病中差異表達了。

既然有差異表達了，那究竟有什么影響呢？先來看看circRNA是什么？

        1.  circRNA（circular RNA，環(huán)狀RNA）是一類具有閉合環(huán)狀結構的非編碼RNA分子，沒有5′ 帽子結構和3′ poly

（A）結構，主要位于細胞質(zhì)或儲存于外泌體中，不受RNA外切酶影響，表達更穩(wěn)定且不易降解，已被證明廣泛存在于

多種真核生物體內(nèi)。

        2. 根據(jù)環(huán)狀RNA剪接來源的不同，將其分為外顯子環(huán)化形成的環(huán)狀RNA（exonic cirRNAs）和內(nèi)含子環(huán)化形成的

環(huán)狀RNA（cirRNAs）。大多數(shù)circRNA是由外顯子環(huán)化而成，也有部分circRNA是由內(nèi)含子環(huán)化而成的套索結構

（lariat）。同時由于circRNA含有大量的miRNA應答原件（MREs），能與AGO蛋白形成RNA誘導沉默復合體（RISC）

的催化核心，最終導致circRNA降解。

按來源歸類CircRNA的種類

①全外顯子型的circRNA；

②內(nèi)含子和外顯子組合的EICircRNA；

③內(nèi)含子組成的套索型ciRNA；

④由病毒RNA基因組、tRNA、rRNA、snRNA等環(huán)化產(chǎn)生的circRNA。

circRNA生物學功能

       circRNA主要存在于細胞質(zhì)或外泌體中，具有組織特異性、疾病特異性、時序特異性及高穩(wěn)定性等特征。近幾年，大

量的研究表明circRNA在生物的生長發(fā)育、脅迫應答、疾病發(fā)生和發(fā)展等方面密切相關，并預測其在疾病診斷標記物等方

面的應用前景，但其生物學功能在很大程度上仍然未知。目前認可度比較高的circRNA生物學功能，歸類如下：

  1. miRNA sponge：circRNA富含miRNA結合位點來充當miRNA海綿作用，阻止miRNA在3′ 非翻譯區(qū)與mRNA相互

作用，進而間接調(diào)控miRNA下游靶基因的表達。

  2.調(diào)控蛋白結合：circRNA通過與mRNA調(diào)節(jié)的結合蛋白（RBP）結合，進而改變剪接模式或mRNA穩(wěn)定性。

  3.調(diào)控基因轉錄：circRNA與RNA聚合酶Ⅱ相互作用并調(diào)節(jié)轉錄，或者EIcircRNA可與小核糖核蛋白互作用，再與RNA聚

合酶Ⅱ結合。

  4.編碼功能：circRNA雖然屬于非編碼RNA，但也有部分circRNA可被核糖體翻譯并編碼多肽，進而行使調(diào)控功能。

技術流程

服務優(yōu)勢

    1.成環(huán)效率好，穩(wěn)定性高

circRNAs 表達載體上加有艾基生物獨家研發(fā)的上下游環(huán)化框架，對各種長度的目標序都有很好的環(huán)化效果；目前驗證過的

所有 circRNAs 環(huán)化效率都在50% 以上，能有效保證至少100倍以上過表達效率。

2.便捷服務

可提供預測circRNA編碼能力，提供circRAN的ID號，物種即可，訂購構建服務，免費贈送1ug總量的陰性對照質(zhì)粒。

3.序列環(huán)化準確

環(huán)化框架內(nèi)部引入的特異環(huán)化介導序列可有效保證目標 circRNAs 的線性序列精確環(huán)化。

4.系統(tǒng)多樣性高

可提供基于細胞瞬時，慢病毒的表達系統(tǒng)；也可提供表達GFP熒光或著嘌呤霉素等抗性基因的系統(tǒng)，以便利于篩選。

現(xiàn)有環(huán)化載體

我司客戶發(fā)表的部分與本服務相關SCI文章

【1】Wei Dong ,Junming Bi ,Hongwei Liu ,Dong Yan ,Qingqing He ,Qianghua Zhou ,Qiong Wang 

Circular RNA ACVR2A suppresses bladder cancer cells proliferation and metastasis through miR-626/EYA4 axis

Molecular Cancer. 2019 May 17;18(1):95. doi: 10.1186/s12943-019-1025-z.  

PMID: 31101108;PMCID: PMC6524247

【2】Yinjie Su ,Weilian Feng ,Juanyi Shi,Luping Chen , Jian Huang , Tianxin Lin .

circRIP2 accelerates bladder cancer progression via miR-1305/Tgf-β2/smad3 pathway

Molecular Cancer. 2020 Feb 4;19(1):23. doi: 10.1186/s12943-019-1129-5. PMID: 32019579 PMCID: PMC6998850

【3】Dong Yan,Wei Dong,Qingqing He, Meihua Yang, Lifang Huang, Jianqiu Kong,,Haide Qin.

Circular RNA circPICALM sponges miR-1265 to inhibit bladder cancer metastasis and inflfluence 

FAK phosphorylation

EBioMedicine. 2019 Oct; 48: 316–331. doi: 10.1016/j.ebiom.2019.08.074.PMCID: PMC6838432;PMID: 31648990

【4】Weikai Xiao,Shaoquan Zheng,Yutian Zou, Anli Yang,Xinhua Xie.

CircAHNAK1 inhibits proliferation and metastasis of triple-negative breast cancer by modulating miR-421 and RASA1

Aging (Albany NY). 2019 Dec 31; 11(24): 12043–12056.doi: 10.18632/aging.102539.PMCID: PMC6949091;

PMID: 31857500

【5】Qingqing He , Lifang Huang ,Dong Yan, Junming Bi , Meihua Yang,Jian Huang , Tianxin Lin.

CircPTPRA acts as a tumor suppressor in bladder cancer by sponging miR-636 and upregulating KLF9

Aging (Albany NY). 2019 Dec 10;11(23):11314-11328.doi: 10.18632/aging.102530.PMID: 31821171 ;

PMCID: PMC6932899

【6】Haomin Li, Baoli Heng, Peng Ouyang, Xuexia Xie, Tingshun Zhang, Guo Chen, Zheng Chen, Kahong.

Comprehensive profling of circRNAs and the tumor suppressor function of circHIPK3 in clear cell renal carcino

Journal of Molecular Histology volume 51, pages317–327 (2020).https://doi.org/10.1007/s10735-020-09882-9