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動(dòng)植物基因組de novo 測(cè)序

樣品總量：小片段文庫(kù)樣本制備需要總量大于1 μg 的樣品，mate-pair 文庫(kù)（2 kb、5 kb、10 kb、）樣品，制備需要總量20-50 μg ，

為保證實(shí)驗(yàn)質(zhì)量及延續(xù)性，請(qǐng)一次性提供至少2 次樣本制備總量;

樣品濃度純度：樣品濃度>200 ng/μl，OD260/280 介于1.8-2.0 之間，無(wú)蛋白質(zhì)、RNA 或者肉眼可見(jiàn)雜質(zhì)污染;

樣品質(zhì)量：基因組完整、無(wú)降解，電泳結(jié)果基因組DNA 主帶應(yīng)在入-Hind llldigest 最大條帶23 KB 以上且主帶清晰，無(wú)彌散;

樣品保存：請(qǐng)保存于干粉、酒精、TE buffer 或超純水中，并請(qǐng)?jiān)跇悠沸畔沃凶⒚鳌?/p>

動(dòng)植物基因組重測(cè)序

DNA 樣品總量：每次建庫(kù)需要準(zhǔn)備樣品1 μg，建議單次送樣提供2 次制備總量；

樣品濃度和純度：樣品濃度>50 ng/μl，OD260/280 介于1.8-2.0 之間，無(wú)肉眼可見(jiàn)雜質(zhì)污染，基因組完整、無(wú)降解，電泳中DNA 主帶

應(yīng)大于23 kb；

樣品選擇：對(duì)于植物樣品建議選取黑暗培養(yǎng)的黃化苗或嫩苗，動(dòng)物樣品應(yīng)選擇肌肉、血等脂肪含量較少的組織進(jìn)行取樣；

樣品保存：請(qǐng)選擇干粉、酒精、TE 或超純水的保存方式。

全外顯子組及目標(biāo)區(qū)域重測(cè)序

DNA 樣品總量：請(qǐng)一次性提供至少1 μg 高質(zhì)量的基因組DNA；

樣品濃度和純度：樣品濃度>50 ng/μl，OD260/280 介于1.8-2.0 之間，無(wú)肉眼可見(jiàn)污染;

樣品質(zhì)量：基因組完整、無(wú)降解，電泳中DNA 主帶應(yīng)大于23 kb；

樣品選擇：對(duì)于植物樣品建議選取黑暗培養(yǎng)的黃化苗或嫩苗，動(dòng)物樣品應(yīng)選擇肌肉、血等脂肪含量較少的組織進(jìn)行取樣;

樣品保存：請(qǐng)選擇干粉、酒精、TE 或超純水中進(jìn)行保存。

微生物基因組de novo 測(cè)序

DNA 樣品總量：小片段文庫(kù)樣品制備需要總量3 μg 的樣品，mate-pair 文庫(kù)（2 kb、5 kb、10 kb）樣品制備需要10-50 μg 的樣

品, 為保證實(shí)驗(yàn)質(zhì)量及延續(xù)性，請(qǐng)一次性提供至少2 次樣品制備量;

樣品濃度和純度：樣品濃度>100 ng/μl，OD260/280 介于1.8-2.0 之間，無(wú)肉眼可見(jiàn)污染;

樣品質(zhì)量：基因組完整、無(wú)降解;

樣品選擇：對(duì)于細(xì)菌和真菌樣品，希望盡量來(lái)自于同一個(gè)菌株，不要有宿主DNA 污染;

樣品保存：請(qǐng)選擇干粉、酒精、TE 或超純水的保存方式之一。

轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

轉(zhuǎn)錄組樣品：RNA 樣品總量: ≥ 1.0 μg，RNA 樣品濃度: ≥ 50 ng/μl；

樣品濃度和純度：樣品濃度>100 ng/μl，OD260/280 介于1.8-2.0 之間，無(wú)肉眼可見(jiàn)污染;

樣品質(zhì)量：使用Agilent Bioanalyzer 儀器檢測(cè)，則獲得的總的RNA 28S：18S >1，RIN 動(dòng)物>7，RIN 植物 >6.5；

樣品選擇：對(duì)于細(xì)菌和真菌樣品，希望盡量來(lái)自于同一個(gè)菌株，不要有宿主DNA 污染;

樣品保存：請(qǐng)選擇乙醇、DEPC 水保存樣品，并在樣品信息單中注明;

樣品運(yùn)輸：樣品請(qǐng)置于1.5 ml 管中，并使用封口膜封好后干冰運(yùn)輸, 請(qǐng)勿反復(fù)凍融。

小RNA 測(cè)序

RNA 樣品總量：一次性提供至少3 μg 高質(zhì)量的總RNA；

樣品濃度和純度：樣品濃度>100 ng/μl，OD260/280 介于1.8-2.0 之間，無(wú)肉眼可見(jiàn)污染;

樣品質(zhì)量：使用Agilent Bioanalyzer 儀器檢測(cè)，則獲得的總的RNA 28S：18S >1，RNA>7.5；

樣品保存：請(qǐng)選擇乙醇、DEPC 水保存樣品，并在樣品信息單中注明;

樣品運(yùn)輸：樣品請(qǐng)置于1.5 ml 管中，并使用封口膜封好，放置足夠的干冰運(yùn)輸。

lncRNA 測(cè)序

轉(zhuǎn)錄組樣品：RNA 樣品總量 ≥ 2.0 μg，RNA 樣品濃度 ≥ 100 ng/μl；

樣品濃度和純度：樣品濃度>100 ng/μl，OD260/280 介于1.8-2.0 之間，無(wú)肉眼可見(jiàn)污染;

樣品質(zhì)量：使用Agilent Bioanalyzer 儀器檢測(cè)，則獲得的總的RNA 28S：18S>1，RIN 值 >7.5；

樣品選擇：對(duì)于細(xì)菌和真菌樣品，希望盡量來(lái)自于同一個(gè)菌株，不要有宿主DNA 污染;

樣品保存：請(qǐng)選擇乙醇、DEPC 水保存樣品，并在樣品信息單中注明;

樣品運(yùn)輸：樣品請(qǐng)置于1.5 ml 管中，并使用封口膜封好后干冰運(yùn)輸，請(qǐng)勿反復(fù)凍融。

表觀遺傳學(xué)相關(guān)DNA 測(cè)序

DNA 樣品總量：全基因甲基化測(cè)序需提供3 μg 的基因組DNA，RRBS 需提供至少4 μg 的DNA，ChIP-seq 和MeIDP-seq 需提供

至少30 ng 的抗體富集后的DNA 片段樣品（片段長(zhǎng)度200-500 bp），為保證質(zhì)量和延續(xù)性，請(qǐng)一次性提供至少2 次樣本制備量；

樣品濃度和純度：基因組DNA 樣品濃度>100 ng/μl，富集后DNA 樣品濃度>5 ng/μl，OD260/280 介于1.8-2.0 之間，無(wú)肉眼可見(jiàn)污染；

樣品保存：請(qǐng)選擇乙醇、純水進(jìn)行保存，并在樣品信息單中注明；

樣品運(yùn)輸：請(qǐng)將樣品置于1.5 ml 管中，并用封口膜封好。

宏基因組測(cè)序

樣品總量：環(huán)境細(xì)菌多樣性分類一次文庫(kù)制備所需要的樣品量為1 μg DNA，宏基因組測(cè)序一次文庫(kù)制備所需要的樣品量為3 μg DNA，

為保證實(shí)驗(yàn)的質(zhì)量及延續(xù)性，請(qǐng)一次性提供至少兩次的制備量（注：不同環(huán)境DNA 質(zhì)量差別較大，具體樣品量請(qǐng)咨詢當(dāng)?shù)丶夹g(shù)人員）；

樣品濃度和純度：環(huán)境樣品濃度>50 ng/μl，宏基因組為30 ng/μl，OD260/280 介于1.8-2.0 之間，無(wú)蛋白質(zhì)、RNA 或肉眼可見(jiàn)雜質(zhì)污染；

樣品質(zhì)量：基因組完整、無(wú)降解，電泳結(jié)果基因組DNA 主帶在預(yù)期位置，清晰，無(wú)彌散，cDNA 片段化樣品，片段大小符合預(yù)期位置；

樣品保存：請(qǐng)選擇干粉、酒精、TE buffer 或超純水一種，并在樣品信息單中注明；

樣品運(yùn)輸：請(qǐng)將樣品置于1.5 ml 管中，做好標(biāo)記，并用封口膜好，并同《測(cè)序樣品訂單》一起放在塑料樣品袋封口，基因組DNA 如果

用乙醇沉淀，可以常溫運(yùn)輸。

雙酶切RAD 測(cè)序

客戶提供：目的物種的基因組信息或近源參考基因組的信息，限制性內(nèi)切酶的種類信息；

樣品總量：每個(gè)樣品制備需要大于3 μg 的樣品，為保證實(shí)驗(yàn)質(zhì)量及延續(xù)性，請(qǐng)一次性提供至少4 μg 的樣品；

樣品濃度和純度：樣品濃度>50 ng/μl，OD260/280 介于1.8-2.0 之間，無(wú)蛋白質(zhì)、RNA 或肉眼可見(jiàn)雜質(zhì)污染；

樣品質(zhì)量：基因組完整、無(wú)降解，電泳結(jié)果基因組DNA 主帶應(yīng)在-Hind III digest 最大條帶23 kb 以上且主帶清晰，無(wú)彌散；

樣品保存：請(qǐng)選擇干粉、酒精、TE buffer 或超純水一種，并在樣品信息單中注明。

細(xì)胞器基因組de novo 測(cè)序

樣品總量：使用密度梯度離心分離后的樣品一次制備DNA 文庫(kù)的量至少為0.5 μg DNA，PCR 富集方法樣品一次制備需要至少

200 ng DNA，建議客戶提供兩次計(jì)品的總量；

樣品濃度和純度：OD260/280 介于1.8-2.0 之間，無(wú)蛋白質(zhì)、RNA 或肉眼可見(jiàn)雜質(zhì)污染；

樣品質(zhì)量：基因組完整、無(wú)降解，電泳結(jié)果基因組DNA 主帶清晰，無(wú)彌散；

樣品保存：請(qǐng)選擇干粉、酒精、TE buffer 或超純水一種，并在樣品信息單中注明。

擴(kuò)增子測(cè)序

常見(jiàn)環(huán)境樣本（請(qǐng)使用干冰或冰袋運(yùn)送）：土壤、淤泥、沉積物 ≥ 3 g，糞便 ≥ 500 mg，組織樣本 ≥ 1g；

水體送樣為過(guò)濾后的濾膜( 最適濾膜直徑3-4 cm，孔徑大小一般選擇0.22 μm 或者0.45 μm)；

拭子樣本 ≥ 2 個(gè)；

DNA/PCR 產(chǎn)物（請(qǐng)使用干冰或冰袋運(yùn)送）；

DNA：濃度 ≥ 5 ng/μl，總量 ≥ 150 ng，DNA 要有明顯主帶，無(wú)降解，無(wú)RNA、蛋白質(zhì)等雜質(zhì)污染；

PCR 產(chǎn)物：濃度 ≥ 20 ng/μl，總量 ≥ 400 ng，片段大?。?450 bp，條帶單一，無(wú)降解，無(wú)引物二聚體。