服務(wù)介紹 Service Introduction
隨著高通量測序成本的大幅度降低以及測序效率的大幅度提升,使得目前進(jìn)行全基因組重測序成為一種用來查找變異的常規(guī)手段,重 測序是對(duì)已知基因組的物種的不同個(gè)體或同一個(gè)體的不同組織進(jìn)行全基因組測序,通過與參考基因組比較分析,獲得個(gè)體基因組的序列信 息,得到與參考基因組的各種變異信息,例如 SNP、InDel、SV 、CNV 等變異信息,對(duì)獲得遺傳變異的致病基因、了解群體遺傳學(xué)以及 物種的進(jìn)化過程、進(jìn)行自然選擇等研究具有重要的意義。
技術(shù)流程 Technical Procedures
利用物理方法將基因組 DNA 進(jìn)行隨機(jī)打斷后,根據(jù)建庫所需片段大小進(jìn)行回收,利用標(biāo)準(zhǔn)的 Illumina 建庫流程構(gòu)建小片段測序文庫, 采用 150PE 模式進(jìn)行測序,總體的測序深度在 30×,但根據(jù)不同的實(shí)驗(yàn)測序要求測序深度可以進(jìn)行調(diào)整。
生物信息學(xué)分析 Bioinformatics Analysis
樣品要求 Sample Requirements
實(shí)驗(yàn)類型 | DNA樣品總量 | 樣品濃度和純度 | 樣品保存 | 樣品選擇 |
動(dòng)植物基因組重測序 | ≥1 μg | 樣品濃度 >50 ng/μl,OD260/280 介于 1.8-2.0 之間,無肉眼可見雜質(zhì)污染,基因組完整、無降解,電泳中 DNA 主帶應(yīng)大于 23 kb | 請(qǐng)選擇干粉、酒精、TE 或超純水的保存方式 | 對(duì)于植物樣品建議選取黑暗培養(yǎng)的黃化苗或嫩苗,動(dòng)物樣品應(yīng)選擇肌肉、血等脂肪含量較少的組織進(jìn)行取樣 |