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服務(wù)介紹 Service Introduction

擴(kuò)增子測(cè)序主要通過對(duì)特定長(zhǎng)度的 PCR 產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序分析，細(xì)菌的16S rRNA基因和真菌的ITS基因結(jié)構(gòu)既具有保守性，又具有高變性。通過測(cè)序結(jié)果與數(shù)據(jù)庫(kù)比較，可以分析環(huán)境細(xì)菌/真菌的菌群結(jié)構(gòu)和多樣性。針對(duì)環(huán)境樣本，16S/18S/ITS 等基因擴(kuò)增子測(cè)序是研究環(huán)境微生物多樣性及群落組成差異的重要技術(shù)手段之一。

提供的服務(wù) Services

根據(jù)不同的研究目的和需求，我們提供 3 種擴(kuò)增子產(chǎn)品：16S rDNA 測(cè)序、ITS 測(cè)序及目標(biāo)區(qū)域擴(kuò)增子測(cè)序。具體介紹如下：

1、16S rDNA 測(cè)序：16S rDNA 為編碼原核生物核糖體小亞基 rRNA 的 DNA 序列，具有 10 個(gè)保守區(qū)域和 9 個(gè)高變區(qū)域（V1-V9），其中保守區(qū)在細(xì)菌間差異不大，高變區(qū)具有屬或種的特異性，對(duì) 16S rDNA 某個(gè)高變區(qū)進(jìn)行測(cè)序，用于研究環(huán)境微生物中細(xì)菌或古菌的群落結(jié)構(gòu)多樣性。

2、ITS 測(cè)序：ITS 分為兩個(gè)區(qū)域：ITS1 和 ITS2，ITS1 位于真核生物 rDNA 序列 18S 和 5.8S 之間，ITS2 位于真核生物 rDNA 序列 5.8S 和 28S 之間。對(duì) ITS1或 ITS2 進(jìn)行測(cè)序，用于研究環(huán)境微生物中真菌群落結(jié)構(gòu)多樣性。

3、目標(biāo)區(qū)域擴(kuò)增子測(cè)序：根據(jù)客戶的研究需求，利用第二代高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)某些目標(biāo)基因的 PCR 產(chǎn)物提供測(cè)序及分析服務(wù)。

實(shí)驗(yàn)流程

分析內(nèi)容

樣品要求 Sample Requirements

送樣建議	送樣量		重復(fù)樣品數(shù)	DNA總量	DNA濃度	DNA純度A260/A280	DNA完整性	PCR 產(chǎn)物
腸道樣品	糞便	≥1g，至少大于500mg	10-20個(gè)	m≥0.25μg 推薦m≥0.5μg	c＞5ng/μl	1.8~2.0	DNA無降解，即電泳有明顯的主條帶	濃度 ≥ 20 ng/μl，總量 ≥ 400 ng，片段大?。?nbsp;450 bp，條帶單一，無降解，無引物二聚體。
環(huán)境樣品	水體	50ml，推薦使用濾膜推注，2片以上	3-5個(gè)
土壤樣品	土壤、淤泥	≥50g	10個(gè)